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1、要做好嫁接工作，嫁接是防治一些頑固病害的高效方法。在西瓜種植及嫁接砧木的選擇上要選擇親和力強的品種，另外在嫁接時要注意、控制棚內濕度、經常通風通光，溫度要掌握好，溫度低時要用火爐增溫或者其它方式。嫁接時，嫁接人員要注意個人衛生以免造成嫁接苗傷口感染，甚至不愈合，從而影響西瓜苗成活率。砧木選擇一般要選擇實心、綠稈的南瓜砧木，西瓜種子要選擇與砧木配套的品種，有了這些才能確保嫁接苗又好又壯。
2、防好西瓜幼苗猝倒病。這種病發生在幼苗期，尤以三葉期以前最易發生，氣溫低、土壤濕度大時候發病嚴重。發病初期在幼苗近地點處呈黃色小漬狀，后成黃褐色而干枯收縮，病害發展很快，子葉尚未凋萎，幼苗即刻猝倒，濕度大時，在病部及其周圍的土面上可出一層白色絮狀菌絲體，為真菌，這種菌可在土壤中越冬，土壤10～16℃時易發病。防治方法：可用50%多菌靈進行拌土或者制成苗床土。
3、控制住西瓜疫?。捍瞬“l生在幼苗期時較多，出生暗綠色水浸狀圓形的不整齊的病斑，并迅速擴展。濕度大時腐爛，于后為淡褐色，易破碎，幼苗莖葉、基部染病水浸狀，出現暗綠色凹陷斑，包圍莖部且腐爛，莖部以下全部枯死。此病病院為真菌。應選用抗病品種，種子種植前應進行消毒，用殺毒礬或者乙磷鋁進行噴霧消毒。
4、嚴防西瓜漚根?。涸摬∫惨自谟酌缙诎l生，幼苗生長緩慢，葉片萎縮、萎蔫，根部最初成黃銹色，并遲遲不發新根，變黏腐爛，至幼苗上部萎蔫死亡。這種病主要是土壤濕度過大，土壤溫度低造成。在土壤低溫高濕的條件下，根發育受阻，根部的再生能力、吸收功能、呼吸作用受到嚴重抑制，根毛大批死亡，而使地上部分萎蔫。育苗時候盡量用育苗碗或者營養缽育苗，主要濕度，水不要較大。
